Le sue pareti conservano prove inconfutabili dell’origine bizantina di Botrugno. Durante recenti lavori di restauro sono emersi affreschi del periodo italo-greco salentino, risalenti alla prima metà del Trecento.

Nelle pitture, la Madonna col Bambino Theotokos (Madre di Dio), è accompagnata da profeti e Santi, secondo il modello iconografico bizantino locale. Il riferimento alla cultura orientale è confermato inoltre dall’inequivocabile schema benedicente delle mani e dagli abiti della Vergine, del Bambino e dei profeti. Il catino e la parete absidali risalgono alla struttura originaria, databile al Duecento, mentre il resto dell’edificio è stato ricostruito nel Settecento.